El Centro de Internamiento de Extranjeros de la Zona Franca ha sido objeto de polémica desde antes incluso de su entrada en funcionamiento, en verano del 2006. El 25 de junio de este año la Policía Nacional detuvo a 59 personas, entre ellas dos abogados y dos cámaras de televisión, que habían ocupado el centro dentro de una denominada Segunda caravana europea por la libertad de movimientos y contra los centros de internamiento, operación en la que participaron alrededor de doscientas personas. Los manifestantes saltaron las vallas de seguridad y accedieron al recinto, entonces desocupado, y procedieron a cortar los cables del circuito cerrado de televisión mientras colgaban diversas pancartas con el lema “No a los centros de internamiento, libertad de expresión”. La actuación de la Policía Nacional, con el apoyo de los Mossos d´Esquadra, acabó con el incidente, que se cerró sin heridos ni daños reseñables en las instalaciones.